凍干機的凍干法則基本上在0℃以下進行，即在產品凍結的狀態下進行，解析干燥的時候一般不超過60℃。在真空條件下，當水蒸汽直接升華出來后，藥物剩留在凍結時的冰架中，形成類似海綿狀疏松多孔架構，因此它干燥后體積大小幾乎不變。再次使用前，只要加入注射用水，又會立即溶解。
凍干機使用過程注意事項：
1、樣品的制備應該盡可能地擴展它們的表面積，并且不含酸堿和揮發性有機溶劑；
2、須等樣品完全凍結成冰才能操作，如有殘留液體會造成氣化噴射；
3、注意冷阱約為零下65度，可以做低溫冰箱使用，須戴保溫手套操作，防止凍傷；
4、啟動真空泵前，檢查出水閥控制是否擰緊，充氣閥是否可以關閉，有機玻璃罩與橡膠圈的接觸面之間是否具有清潔無污物，良好環境密封；
5、一般情況下，該機不得連續使用超過48小時；
6、樣品在冷凍的過程中，溫度逐漸降低，可以將樣品取出回暖一段時間后，再繼續干燥，以縮短干燥時間。
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